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關(guān)聯(lián)分析的意義（關(guān)聯(lián)分析的意義和作用）

發(fā)布時間：2023-03-16 22:25:09 稿源：創(chuàng)意嶺閱讀： 1477 問大家

大家好！今天讓創(chuàng)意嶺的小編來大家介紹下關(guān)于關(guān)聯(lián)分析的意義的問題，以下是小編對此問題的歸納整理，讓我們一起來看看吧。

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本文目錄:

1、2018-11-06 GWAS實戰(zhàn)（七）plink 進(jìn)階之關(guān)聯(lián)分析
2、關(guān)聯(lián)分析在數(shù)據(jù)挖掘中的作用？關(guān)聯(lián)分析的實例有哪些？
3、請舉例說明什么是數(shù)據(jù)挖掘的關(guān)聯(lián)分析任務(wù)
4、生物信息學(xué)中的連鎖分析與關(guān)聯(lián)分析有哪些區(qū)別和聯(lián)系呢？

關(guān)聯(lián)分析的意義（關(guān)聯(lián)分析的意義和作用）

一、2018-11-06 GWAS實戰(zhàn)（七）plink 進(jìn)階之關(guān)聯(lián)分析

這一節(jié)說的是association analysis 也是我們分析單標(biāo)記回歸得到的結(jié)果（P值）的一步，這一步的結(jié)果可以用來與我第一講聯(lián)合起來，形成一個閉環(huán)。跑跑標(biāo)準(zhǔn)流程。

Association analysis 可以有很多用處，比如：

我這了主要介紹一個Linear and logistic models

這個主要是可以加入?yún)f(xié)變量作為控制，很靈活，但是可能速度會慢一點

說明上說最基礎(chǔ)的用法是這樣：

但是這里我遇到一個問題

我bed bim fam 是不包含表型數(shù)據(jù)的，所以我要自己重新定義一個表型文件

我這里用quantitative traits作為例子

一般來說，就是自己設(shè)置一個文件

然后使用 --pheno 指定這個文件

總共三列

前兩列是family and within-family IDs 第三列是表型

我這里用第一主成分作為表型

咱們來試試看

程序就是這么設(shè)定的

成功啦

生成一個文件 assoc.linear

這個就可以用來畫圖啦

畫圖回到一

這里我解釋一下每一列的意義吧

這個我就簡單介紹到這里

這里我還遇到一些實戰(zhàn)的問題

比如有些數(shù)據(jù)，我算出來極顯著，P值等于0 ，這樣后面畫圖 ylim不能為無窮大，會產(chǎn)生問題，還有就是我的圖莫名其妙變瘦了，很奇怪。

二、關(guān)聯(lián)分析在數(shù)據(jù)挖掘中的作用？關(guān)聯(lián)分析的實例有哪些？

啤酒與尿布的故事

三、請舉例說明什么是數(shù)據(jù)挖掘的關(guān)聯(lián)分析任務(wù)

關(guān)聯(lián)析指兩或事物間存定關(guān)聯(lián),其事物能通其事物進(jìn)行預(yù)測.目挖掘隱藏數(shù)據(jù)間相互關(guān)系數(shù)據(jù)挖掘基本任務(wù)關(guān)聯(lián)(association)順序序貫?zāi)Ｐ?sequencing)關(guān)聯(lián)析指搜索事務(wù)數(shù)據(jù)庫(trarisactional databases)所細(xì)節(jié)或事務(wù),尋找重復(fù)現(xiàn)概率高模式或規(guī)則 ~

四、生物信息學(xué)中的連鎖分析與關(guān)聯(lián)分析有哪些區(qū)別和聯(lián)系呢？

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生物信息學(xué)，是一門綜合學(xué)科。涉及到數(shù)學(xué)，生物學(xué)和計算機(jī)的內(nèi)容。但在我看來，計算機(jī)的基礎(chǔ)需要，但要求不是很高，關(guān)鍵是要有很好的生物學(xué)知識，包括遺傳學(xué)的、生物化學(xué)的、發(fā)育生物學(xué)的、分子生物學(xué)的、植物生理學(xué)的知識等等，也就說需要達(dá)到這樣的一個要求：在進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時，能對各種分析結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)的評價，并給出最優(yōu)的分析策略。同時也應(yīng)該有純熟的數(shù)理基礎(chǔ)，包括統(tǒng)計學(xué)的、拓?fù)鋵W(xué)的，這樣才能把待分析的問題轉(zhuǎn)換成可計算的模型，最后能給出實現(xiàn)的程序。從個人來說，因為生物信息學(xué)是一個非常大的領(lǐng)域，所以，關(guān)鍵是要確定自己的研究方向。比如，以關(guān)聯(lián)分析為方向的生物信息學(xué)，那么就要掌握好各種關(guān)聯(lián)分析的統(tǒng)計分析方法，有很強(qiáng)的數(shù)據(jù)管理能力，足夠好的序列分析能力（這是進(jìn)行variation查找和分析的基礎(chǔ)）。回到6年以前，如果決定在生物信息學(xué)上發(fā)展，那么我也許會做下面這些事情：首先，從最不重要的計算機(jī)這個方面來說：要掌握好bash等腳本語言，一般的linux問題都能很好的解決。熟練使用apache，mysql等基礎(chǔ)軟件工具，用joomla等CMS配置搭建網(wǎng)站。應(yīng)該努力精通perl，bioperl，以基于此的各種分析工具，比如gbrowser，cmap等。足夠好的c/c++語言能力，這是實現(xiàn)新算法的最高效語言。應(yīng)該努力精通R語言，這是進(jìn)行統(tǒng)計分析的基礎(chǔ)工具。如果有機(jī)會，學(xué)學(xué)erlang這樣一些函數(shù)式語言吧。

關(guān)聯(lián)分析的意義（關(guān)聯(lián)分析的意義和作用）